产品货号:
JN0050
中文名称:
qPCR SuperMix(探针法)
英文名称:
BalbStart Probe qPCR SuperMix
产品规格:
5mL|25mL
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品是在PCR体系中添加荧光探针(TaqMan或Molecular Beacon等),在扩增过程中,其荧光量与扩增产物量成正比,通过荧光量来测定样品核酸量的一款试剂盒。试剂盒中已经将新型工艺修饰的HotStart Taq DNA聚合酶、针对qPCR优化的最适反应Buffer、dNTPs、PCR稳定剂及增强剂等试剂预混在一起,是一种2×浓度的预混型试剂。
新型工艺修饰的HotStart Taq DNA聚合酶能够在低温条件下有效抑制非特异性扩增,显著提高扩增效率及灵敏度,能够在更广的范围内进行准确定量。尤其针对一些特殊模板,如非洲猪瘟病毒等,效果更佳。试剂盒中配有不同浓度的ROX Reference Dye,用于不同仪器校正孔间荧光信号误差。
- 高特异性:采用特殊工艺制造的HotStart Taq DNA聚合酶,可以进行热启动法PCR反应,大大提高了PCR扩增的特异性。
- 高效:精心配制的Real Time PCR专用2×SuperMix,具有更高扩增效率和扩增灵敏度。
- 快捷:PCR反应所必需试剂集于一管之中,数分钟即可完成反应体系配制。
组分 | 5mL | 25mL |
2×BalbStart Probe qPCR SuperMix | 1mL×5 | 1mL×25 |
RNase Free Water | 1mL×5 | 1mL×23 |
ROX I | 200μL | 1mL |
ROX II | 200μL | 1mL |
保存:-20℃
使用时请上下颠倒轻轻均匀混合,避免起泡,并经轻微离心后使用。反应液的配制、分装请使用新的(无污染的)枪头、Microtube等,避免污染。
- 常用反应体系
成分 用量 2×BalbStart Probe qPCR SuperMix 10μL 上游引物 0.2~1.0μM(终浓度) 下游引物 0.2~1.0μM(终浓度) 探针(10μM) 0.4μL 模板 1~2μL ROX(需根据机器型号选择) 0.4μL RNase Free Water 至20μL - 常用PCR循环
两步法可获得高特异性,三步法可获得高扩增率,根据需求选择不同的扩增程序。- 两步法扩增程序:
温度 时间 循环数 94℃ 1min 1 95℃ 20s 35~45 60℃ 30s - 三步法PCR扩增程序:
温度 时间 循环数 94℃ 1min 1 95℃ 20s 35~45 50~60℃ 20s 72℃ 30s
- 两步法扩增程序:
- 无Ct值出现
- 检测荧光信号的步骤有误:一般染料法采用72℃延伸时采集,探针法则一般在退火结束时或延伸结束采集信号。
- ROX使用错误或者加量有偏差:当ROX浓度太低或太高时,都会影响机器修正后显示的荧光值,Ct值会显示为unknown或空白,可以根据仪器的类型选择合适的ROX类型(I或II),并严格按照1∶50的比例添加。
- 引物或探针降解:可通过电泳检测其完整性。
- 模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起。
- 模板降解:避免杂质的引入及反复冻融,必要时可以重新制备模板。
- 检测荧光信号的步骤有误:一般染料法采用72℃延伸时采集,探针法则一般在退火结束时或延伸结束采集信号。
- Ct值出现过晚(Ct>38)
- 扩增效率低,反应条件不够优化:设计更好的引物或探针;适当降低退火温度;改为三步法扩增。
- PCR各种反应成分降解或上样量不足:更换试剂或加大上样量,重复实验。
- PCR产物太长:一般采用80bp~150bp的产物长度。
- 热启动时间过短,酶活性中心没有完全暴露,活性发挥受到了影响:建议热启动时间不低于1分钟。
- 扩增效率低,反应条件不够优化:设计更好的引物或探针;适当降低退火温度;改为三步法扩增。
- 扩增曲线异常,如断裂或者锯齿状曲线?
- ROX使用错误或者加量有偏差:ROX浓度太低或太高时,机器对荧光值进行修正后会产生断裂的曲线,可根据说明书进行调整。
- 分析数据时通道选择不正确,如没有在PCR mix中加入ROX,但分析时在仪器设置中选择了ROX选项,应根据反应的具体操作情况选择合适的通道。
- 模板的浓度太高/降解或荧光染料发生了降解:建议更换模板或mix。
- 反应管内有气泡:混匀后离心,避免气泡的残留。
- 程序设置时间不当:适当延长延伸时间(40~60秒),充分收集荧光信号。
- ROX使用错误或者加量有偏差:ROX浓度太低或太高时,机器对荧光值进行修正后会产生断裂的曲线,可根据说明书进行调整。
- 标准曲线线性关系不佳
- 加样存在误差,导致标准品不呈梯度:重新加样并重复实验。
- 标准品出现降解:应避免标准品反复冻融,或重新制备并稀释标准品。
- 引物或探针不佳:重新设计更好的引物和探针。
- 模板中存在抑制物,或模板浓度过高:更换模板或提高模板稀释倍数。
- 加样存在误差,导致标准品不呈梯度:重新加样并重复实验。
- 负对照有信号
- 引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。
- 引物浓度不佳:适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。
- 模板有基因组的污染:RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,可以稀释模板的浓度或者更换模板。
- 反应体系污染:更换mix、水或者引物等,避免交叉污染。
- 引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。
- 溶解曲线不止一个主峰
- 引物浓度过高或者设计不够优化:应降低引物浓度或者重新设计引物,避免产生引物二聚体。
- 体系被污染:更换试剂后重复实验。
- 反应条件不够优化,引起非特异性扩增:设计特异性更高的引物或探针;适当提高退火温度;改为三步法扩增。
- 引物浓度过高或者设计不够优化:应降低引物浓度或者重新设计引物,避免产生引物二聚体。
- 同一试剂在不同仪器上产生不同的曲线,如何判断?
判断标准:扩增效率,灵敏度,特异性。如果扩增效率在90%~110%,都是特异性扩增,可以把数据用于分析。 - 溶解曲线中,Tm不出现在80℃左右是怎么回事?
扩增片段100bp左右的,一般应该出现在80℃左右。如果低于此温度出现,可能是模板降解。 - 溶解程序可否不加?
如果扩增效果好,特异性高,可以选择不加溶解程序(建议加上)。此外,不同的机型对应不同的溶解曲线设置程序,可根据机型进行相应的设置。 - 扩增反应体系5μL,扩增效率低,是什么原因?
反应体系太小,各种因素的影响相对较大,比如引物浓度、模板浓度及金属离子等都会影响扩增效率。
附录1.根据仪器的选择使用ROX:
- ROX I校准的Real Time PCR仪有:
ABI 5700/7000/7300/7700/7900/7900 HT/7900 HT Fast;
ABI StepOne/StepOnePlus及其他仪器。 - 用ROX II校准的Real Time PCR仪有:
ABI 7500/7500 Fast;
ABI ViiA7;
ABI Q6;
ABI Quant Studio 6/7 Flex;
Stratagene MX4000/MX3500P/MX3000P及其他仪器。 - 不需要用ROX校准的Real Time PCR仪有:
Bio-Rad CFX96/CFX 384/iCycler iQ5/iQ/My iQ5/MiniOpticon/Opticon/Opticon/Chromo4;
Eppendorf MasterCyclerrealplex/realplex 2s。
Cepheid SmartCycler;
Illumina Eco qPCR;
Roche Applied Science LightCycler 480;
Thermo Scientific PikoReal Cycler;
Qiagen/Corbett Rotor-Gene Q/Rotor-Gene 3000/Rotor-Gene 6000及其他仪器。
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